Para chamar seu pokemon é simples, pegue a pokebola do pokemon que você deseja chamar, e coloque no slot "Pokeball" do menu. Segue a imagem.

Feito isso, apenas clique na pokebola, e seu pokemon será summonado. Após isso sua pokebola ficará FIXA no slot pokeball, e só poderá ser movida quando: seu pokémon for derrotado, ou você chama-lo de volta para a pokebola, ou você logar. Quando seu pokemon está derrotado, ou não está na pokebola, ela fica
como na imagem abaixo.

Sim, é isso mesmo, com a pokebola do seu pokemon você pode summona-lo e chama-lo de volta. Segue outra GIF para demonstrar o sistema, ao invéz de palavras.